Table 4 Genetic diversity characteristics of the 28 microsatellite loci tested on four Gastrodia taxa
Gastrodia flavilabella | Gastrodia elata | Gastrodia javanica | Gastrodia confusoides | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Locus | Na | Ne | Ho | He | H | F IS | Na | Ne | Ho | He | H | F IS | Na | Ne | Ho | He | H | F IS | Na | Ne | Ho | He | H | F IS |
CT3-32 | 4 | 1.23 | 0.00 | 0.19* | 0.43 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT6-4 | 15 | 8.85 | 0.10 | 0.89* | 2.41 | 0.887 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT6-35 | 2 | 1.08 | 0.00 | 0.08* | 0.17 | 1.000 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT6- 65 | 5 | 2.94 | 0.32 | 0.66* | 1.23 | 0.515 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 2 | 1.06 | 0.06 | 0.06 | 0.13 | -0.030 |
CT6-90 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT6-99 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT6-120 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT6-142 | 2 | 1.04 | 0.00 | 0.04* | 0.10 | 1.000 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-ACT-74 | 10 | 4.03 | 0.16 | 0.75* | 1.80 | 0.783 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-ACT-88 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-ACT-136 | 2 | 2.00 | 1.00 | 0.50* | 0.69 | -1.000 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 2 | 2.00 | 1.00 | 0.50* | 0.69 | -1.000 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AG-35 | 3 | 2.56 | 0.00 | 0.61* | 1.00 | 1.000 | 7 | 4.37 | 0.05 | 0.77* | 1.64 | 0.935 | 2 | 1.11 | 0.11 | 0.10 | 0.21 | -0.056 | 2 | 1.11 | 0.00 | 0.10* | 0.20 | 1.000 |
CT-AG-45 | 3 | 1.09 | 0.00 | 0.08* | 0.20 | 1.000 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AG-55 | 2 | 1.95 | 0.00 | 0.49* | 0.68 | 1.000 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 2 | 2.00 | 1.00 | 0.50* | 0.69 | -1.000 |
CT-AG-85 | 8 | 3.97 | 0.02 | 0.75* | 1.62 | 0.972 | 5 | 3.86 | 1.00 | 0.74* | 1.43 | -0.349 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AG-88 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 7 | 4.35 | 1.00 | 0.77* | 1.64 | -0.299 |
CT-AG-114 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AG-127 | 3 | 1.14 | 0.00 | 0.12* | 0.28 | 1.000 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AG-140 | 4 | 2.34 | 0.00 | 0.57* | 0.97 | 1.000 | 4 | 1.49 | 0.00 | 0.33* | 0.69 | 1.000 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AG-144 | 2 | 1.17 | 0.00 | 0.15* | 0.28 | 1.000 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AG-145 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AG-157 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AGAT-19 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | 2 | 2.00 | 1.00 | 0.50* | 0.69 | -1.000 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 2 | 2.00 | 1.00 | 0.50* | 0.69 | -1.000 |
CT-AGAT-26 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-AGAT-131 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-CCA-71 | 2 | 2.00 | 1.00 | 0.50* | 0.69 | -1.000 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-CCA-108 | 7 | 3.71 | 0.00 | 0.73* | 1.57 | 1.000 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ |
CT-CCA-137 | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | ─ | 1 | 1.00 | ─ | ─ | ─ | ─ |
Mean | 3.071 | 1.896 | 0.163 | 0.444 | 0.882 | 0.697 | 2.077 | 1.480 | 0.513 | 0.585 | 1.113 | 0.147 | 1.286 | 1.159 | 0.555 | 0.300 | 0.450 | -0.528 | 1.588 | 1.324 | 0.612 | 0.386 | 0.67 | -0.266 |